Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNK2Q07912 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNK2Q07912 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNK2Q07912 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms