Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDE4BQ07343 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDE4BQ07343 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PDE4BQ07343 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE4BQ07343 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms