Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 MET3YJR010W 1536 nt4.6□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 GDB1YPR184W 4611 nt4.6□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 PRP43YGL120C 2304 nt4.6□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 MBP1YDL056W 2502 nt4.6□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 UBP7YIL156W 3216 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 SCM3YDL139C 672 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 IRC6YFR043C 714 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 RPT6YGL048C 1218 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 ATG1YGL180W 2694 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 CIR1YGR207C 786 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 YHR022CYHR022C 771 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 YHR127WYHR127W 732 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 MPP10YJR002W 1782 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 TGL1YKL140W 1647 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 SEC13YLR208W 894 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 YLR311CYLR311C 348 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 YLR374CYLR374C 390 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 CUS1YMR240C 1311 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 CAR1YPL111W 1002 nt4.59□□□□□ -1.67
SSK1Q07084 YJL206CYJL206C 2277 nt4.58□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 ADE4YMR300C 1533 nt4.58□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 MSH1YHR120W 2880 nt4.58□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 MLF3YNL074C 1359 nt4.58□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 GIR2YDR152W 798 nt4.58□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 ADH4YGL256W 1149 nt4.58□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 YJL068CYJL068C 900 nt4.58□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 ELA1YNL230C 1140 nt4.58□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 CBC2YPL178W 627 nt4.58□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 CBP1YJL209W 1965 nt4.58□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 GAS2YLR343W 1668 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 FUM1YPL262W 1467 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 AVT3YKL146W 2079 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 ARP2YDL029W 1176 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 UBC1YDR177W 648 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 YDR222WYDR222W 1248 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 AUA1YFL010W-A 285 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 CIA2YHR122W 696 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 SPL2YHR136C 447 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 PGU1YJR153W 1086 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 SPS18YNL204C 903 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 DSC2YOL073C 969 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 QCR2YPR191W 1107 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 CDC28YBR160W 897 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 UBS1YBR165W 834 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 SIS2YKR072C 1689 nt4.57□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 IFM1YOL023W 2031 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 TDA7YNL176C 1911 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 UBX7YBR273C 1311 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 LUC7YDL087C 786 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 YDR161WYDR161W 1164 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 MRPL7YDR237W 879 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 MLC1YGL106W 450 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 YIL152WYIL152W 708 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 YKR047WYKR047W 306 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 RPS0BYLR048W 759 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 CDA2YLR308W 939 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 YLR346CYLR346C 306 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 CLA4YNL298W 2529 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 ROT2YBR229C 2865 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 EKI1YDR147W 1605 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 HOF1YMR032W 2010 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 MSC7YHR039C 1935 nt4.56□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 SUM1YDR310C 3189 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 THP1YOL072W 1368 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 ZUO1YGR285C 1302 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 SIF2YBR103W 1608 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 KNH1YDL049C 807 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 SLC1YDL052C 912 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 WSS1YHR134W 810 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 DAL3YIR032C 588 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 NIT2YJL126W 924 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 MRPL13YKR006C 795 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 SCW10YMR305C 1170 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 ETT1YOR051C 1239 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 SSP2YOR242C 1116 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 CLF1YLR117C 2064 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 TEA1YOR337W 2280 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 YGR125WYGR125W 3111 nt4.55□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 HPC2YBR215W 1878 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 VHS2YIL135C 1311 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 GAL4YPL248C 2646 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 SCS2YER120W 735 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 NTR2YKR022C 969 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 YLR036CYLR036C 612 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 HLJ1YMR161W 675 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 ETR1YBR026C 1143 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 MET31YPL038W 534 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 YCL012CYCL012C 405 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 HXT4YHR092C 1731 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 PCA1YBR295W 3651 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 PXA1YPL147W 2613 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 TIP20YGL145W 2106 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 ARN1YHL040C 1884 nt4.54□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 RNY1YPL123C 1305 nt4.53□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 PHO8YDR481C 1701 nt4.53□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 THI22YPR121W 1719 nt4.53□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 CAF4YKR036C 1932 nt4.53□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 PRR2YDL214C 2100 nt4.53□□□□□ -1.68
SSK1Q07084 COS4YFL062W 1140 nt4.53□□□□□ -1.68
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