Protein–RNA interactions for Protein: Q06587

RING1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RING1Q06587 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RING1Q06587 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RING1Q06587 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RING1Q06587 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RING1Q06587 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RING1Q06587 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RING1Q06587 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RING1Q06587 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RING1Q06587 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RING1Q06587 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RING1Q06587 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RING1Q06587 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RING1Q06587 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RING1Q06587 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RING1Q06587 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RING1Q06587 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RING1Q06587 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RING1Q06587 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RING1Q06587 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RING1Q06587 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RING1Q06587 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RING1Q06587 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RING1Q06587 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RING1Q06587 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RING1Q06587 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RING1Q06587 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RING1Q06587 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RING1Q06587 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RING1Q06587 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RING1Q06587 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RING1Q06587 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RING1Q06587 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RING1Q06587 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RING1Q06587 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RING1Q06587 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RING1Q06587 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RING1Q06587 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RING1Q06587 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RING1Q06587 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RING1Q06587 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RING1Q06587 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RING1Q06587 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RING1Q06587 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RING1Q06587 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RING1Q06587 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RING1Q06587 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RING1Q06587 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RING1Q06587 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RING1Q06587 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RING1Q06587 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RING1Q06587 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RING1Q06587 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RING1Q06587 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RING1Q06587 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RING1Q06587 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RING1Q06587 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RING1Q06587 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RING1Q06587 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RING1Q06587 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RING1Q06587 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RING1Q06587 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RING1Q06587 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RING1Q06587 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RING1Q06587 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RING1Q06587 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RING1Q06587 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RING1Q06587 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RING1Q06587 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RING1Q06587 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RING1Q06587 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RING1Q06587 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RING1Q06587 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RING1Q06587 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RING1Q06587 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RING1Q06587 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RING1Q06587 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RING1Q06587 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RING1Q06587 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RING1Q06587 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RING1Q06587 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RING1Q06587 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RING1Q06587 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RING1Q06587 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RING1Q06587 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RING1Q06587 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RING1Q06587 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RING1Q06587 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RING1Q06587 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RING1Q06587 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RING1Q06587 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RING1Q06587 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RING1Q06587 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RING1Q06587 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RING1Q06587 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RING1Q06587 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RING1Q06587 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RING1Q06587 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RING1Q06587 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RING1Q06587 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RING1Q06587 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms