Protein–RNA interactions for Protein: Q06505

SPN1, Transcription factor SPN1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPN1Q06505 BUD7YOR299W 2241 nt5.51□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 WTM2YOR229W 1404 nt5.51□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 PCL6YER059W 1263 nt5.51□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 RPL28YGL103W 450 nt5.51□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 NTR2YKR022C 969 nt5.51□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 YLR036CYLR036C 612 nt5.51□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 MRPL39YML009C 213 nt5.51□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 YPL191CYPL191C 1083 nt5.51□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 MAD3YJL013C 1548 nt5.51□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 CLD1YGR110W 1338 nt5.5□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 GRS1YBR121C 2004 nt5.5□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 YDL027CYDL027C 1263 nt5.5□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 AAD6YFL056C 639 nt5.5□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 SED5YLR026C 1023 nt5.5□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 YLR346CYLR346C 306 nt5.5□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 TRS33YOR115C 807 nt5.5□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 AIM10YER087W 1731 nt5.5□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 PUT1YLR142W 1431 nt5.49□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 MED2YDL005C 1296 nt5.49□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 ROT1YMR200W 771 nt5.49□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 YPL014WYPL014W 1146 nt5.49□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 CTF18YMR078C 2226 nt5.49□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 YHR177WYHR177W 1362 nt5.49□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 MST1YKL194C 1389 nt5.49□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 MBP1YDL056W 2502 nt5.49□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 RRP3YHR065C 1506 nt5.48□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 KRS1YDR037W 1776 nt5.48□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 YER134CYER134C 537 nt5.48□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 YJR056CYJR056C 711 nt5.48□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 YKL169CYKL169C 384 nt5.48□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 NTH2YBR001C 2343 nt5.48□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 TUP1YCR084C 2142 nt5.48□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 UBA2YDR390C 1911 nt5.48□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 ELP2YGR200C 2367 nt5.48□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 DXO1YDR370C 1329 nt5.48□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 MAF1YDR005C 1188 nt5.47□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 CAB1YDR531W 1104 nt5.47□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.47□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 UBC12YLR306W 567 nt5.47□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 UBA3YPR066W 900 nt5.47□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.47□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.47□□□□□ -1.53
SPN1Q06505 LAS21YJL062W 2493 nt5.46□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 IMG2YCR071C 441 nt5.46□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 RMD5YDR255C 1266 nt5.46□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YGR153WYGR153W 654 nt5.46□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YLR311CYLR311C 348 nt5.46□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 OMS1YDR316W 1416 nt5.46□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 GMC1YDR506C 1827 nt5.46□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 IMD3YLR432W 1572 nt5.46□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 PRM1YNL279W 1986 nt5.46□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 ARN1YHL040C 1884 nt5.45□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 ATM1YMR301C 2073 nt5.45□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 LUC7YDL087C 786 nt5.45□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 PCL9YDL179W 915 nt5.45□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.45□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 PPA2YMR267W 933 nt5.45□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YIF1YNL263C 945 nt5.45□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YOL024WYOL024W 519 nt5.45□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 OAZ1YPL052W 879 nt5.45□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 HPC2YBR215W 1878 nt5.45□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 VHS2YIL135C 1311 nt5.45□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 APM2YHL019C 1818 nt5.44□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 TIP20YGL145W 2106 nt5.44□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 GRX4YER174C 735 nt5.44□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 UIP3YAR027W 708 nt5.44□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 RRP40YOL142W 723 nt5.44□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 BUB3YOR026W 1026 nt5.44□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 PAF1YBR279W 1338 nt5.44□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 RFT1YBL020W 1725 nt5.43□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YEL067CYEL067C 588 nt5.43□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YJR085CYJR085C 318 nt5.43□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.43□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 OMA1YKR087C 1038 nt5.43□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YLL017WYLL017W 312 nt5.43□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 NOP13YNL175C 1212 nt5.43□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 SWI3YJL176C 2478 nt5.43□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 STE7YDL159W 1548 nt5.43□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 IMA1YGR287C 1770 nt5.42□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YHR182WYHR182W 2358 nt5.42□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 KAR2YJL034W 2049 nt5.42□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 SCS2YER120W 735 nt5.42□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 RAD17YOR368W 1206 nt5.42□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 AME1YBR211C 975 nt5.42□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 RAD30YDR419W 1899 nt5.42□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 PMT5YDL093W 2232 nt5.42□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 FUM1YPL262W 1467 nt5.41□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YDR445CYDR445C 408 nt5.41□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YDR509WYDR509W 348 nt5.41□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YGL185CYGL185C 1140 nt5.41□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 SKI8YGL213C 1194 nt5.41□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt5.41□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YJL220WYJL220W 453 nt5.41□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 MHO1YJR008W 1017 nt5.41□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.41□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YGP1YNL160W 1065 nt5.41□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YCL012CYCL012C 405 nt5.41□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 YBR139WYBR139W 1527 nt5.41□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 HIR2YOR038C 2628 nt5.41□□□□□ -1.54
SPN1Q06505 PRO2YOR323C 1371 nt5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms