Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 IES1YFL013C 2079 nt4.23□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 NOP7YGR103W 1818 nt4.23□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 MNN1YER001W 2289 nt4.23□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 SSA2YLL024C 1920 nt4.23□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 YNL247WYNL247W 2304 nt4.22□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 CAB3YKL088W 1716 nt4.22□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 TEA1YOR337W 2280 nt4.22□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt4.22□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 HPM1YIL110W 1134 nt4.22□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 ATP14YLR295C 375 nt4.22□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 YML119WYML119W 1074 nt4.22□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 IMP2YMR035W 534 nt4.22□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 BBP1YPL255W 1158 nt4.22□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 SBE2YDR351W 2595 nt4.22□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 VAC7YNL054W 3498 nt4.22□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 ORC6YHR118C 1308 nt4.21□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 SAP4YGL229C 2457 nt4.21□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 YJR015WYJR015W 1533 nt4.21□□□□□ -1.73
NEJ1Q06148 SNA2YDR525W-A 240 nt4.21□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 ACT1YFL039C 1128 nt4.21□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 DAL3YIR032C 588 nt4.21□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 SER1YOR184W 1188 nt4.21□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 GSM1YJL103C 1857 nt4.21□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 CDC15YAR019C 2925 nt4.21□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 MSC2YDR205W 2175 nt4.2□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 SWC3YAL011W 1878 nt4.2□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 KIN28YDL108W 921 nt4.2□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 LSO1YJR005C-A 282 nt4.2□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 BUD28YLR062C 378 nt4.2□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 HUL4YJR036C 2679 nt4.2□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 TOG1YER184C 2385 nt4.2□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 SER33YIL074C 1410 nt4.2□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 HOYDL227C 1761 nt4.19□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 GSY1YFR015C 2127 nt4.19□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 YCR023CYCR023C 1836 nt4.19□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 YAP1802YGR241C 1707 nt4.19□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 RSM10YDR041W 612 nt4.19□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 ARG82YDR173C 1068 nt4.19□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 ISA1YLL027W 753 nt4.19□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 VID30YGL227W 2877 nt4.19□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 KCC4YCL024W 3114 nt4.19□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 IMD2YHR216W 1572 nt4.19□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 AVT1YJR001W 1809 nt4.18□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 PCL8YPL219W 1479 nt4.18□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 SKG6YHR149C 2205 nt4.18□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 UPC2YDR213W 2742 nt4.18□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 IZH3YLR023C 1632 nt4.18□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 CPR4YCR069W 957 nt4.18□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 YFL064CYFL064C 525 nt4.18□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 YGR066CYGR066C 879 nt4.18□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 SKI6YGR195W 741 nt4.18□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 YNG2YHR090C 849 nt4.18□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 YPR202WYPR202W 717 nt4.18□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 STB2YMR053C 2553 nt4.18□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 PMC1YGL006W 3522 nt4.18□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 PEX30YLR324W 1572 nt4.18□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 YLH47YPR125W 1365 nt4.17□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 GLE2YER107C 1098 nt4.17□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 UBI4YLL039C 1146 nt4.17□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 TOM7YNL070W 183 nt4.17□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 CKB2YOR039W 777 nt4.17□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 YPL025CYPL025C 558 nt4.17□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 CBP3YPL215W 1008 nt4.17□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 MDM30YLR368W 1797 nt4.17□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 YPK9YOR291W 4419 nt4.16□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 RKM2YDR198C 1440 nt4.16□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 YJU2YKL095W 837 nt4.16□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 YAR030CYAR030C 342 nt4.16□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 PRE7YBL041W 726 nt4.16□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 PDX3YBR035C 687 nt4.16□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 SUA7YPR086W 1038 nt4.16□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 PFK1YGR240C 2964 nt4.16□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 ALD3YMR169C 1521 nt4.16□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 ALD2YMR170C 1521 nt4.16□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 SEN1YLR430W 6696 nt4.15□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 SVF1YDR346C 1446 nt4.15□□□□□ -1.74
NEJ1Q06148 YDR056CYDR056C 618 nt4.15□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 TDA5YLR426W 981 nt4.15□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 YNL217WYNL217W 981 nt4.15□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 MSS116YDR194C 1995 nt4.14□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 BUD13YGL174W 801 nt4.14□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 REV7YIL139C 738 nt4.14□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 ECM1YAL059W 639 nt4.14□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 APS1YLR170C 471 nt4.14□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 WTM1YOR230W 1314 nt4.14□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 GCR2YNL199C 1605 nt4.13□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 RPG1YBR079C 2895 nt4.13□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 GCV1YDR019C 1203 nt4.13□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 COQ4YDR204W 1008 nt4.13□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 COA3YJL062W-A 258 nt4.13□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 REC114YMR133W 1287 nt4.13□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 MDM12YOL009C 816 nt4.13□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 REI1YBR267W 1182 nt4.13□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 YCL041CYCL041C 495 nt4.13□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 HOM3YER052C 1584 nt4.13□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 TRE1YPL176C 2352 nt4.13□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 CBF5YLR175W 1452 nt4.12□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 YER133W-AYER133W-A 342 nt4.12□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt4.12□□□□□ -1.75
NEJ1Q06148 CDC48YDL126C 2508 nt4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.2 ms