Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDSRQ06136 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDSRQ06136 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms