Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN1Q05586 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN1Q05586 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.1 ms