Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.73□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 MRP21YBL090W 534 nt4.73□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 DCI1YOR180C 816 nt4.73□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 YOR292CYOR292C 930 nt4.73□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 NHP6AYPR052C 282 nt4.73□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 CTR1YPR124W 1221 nt4.73□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 NOP8YOL144W 1455 nt4.73□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 CBP1YJL209W 1965 nt4.73□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 MNN1YER001W 2289 nt4.72□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 MUM3YOR298W 1440 nt4.72□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 NSG1YHR133C 876 nt4.72□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 BMT5YIL096C 1011 nt4.72□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 FUN19YAL034C 1242 nt4.72□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 PAU17YLL025W 375 nt4.72□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 ROT1YMR200W 771 nt4.72□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 ARG8YOL140W 1272 nt4.72□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 ISU2YOR226C 471 nt4.72□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 CUE2YKL090W 1332 nt4.72□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 PRM7YDL039C 2097 nt4.71□□□□□ -1.65
RRN11Q04712 GTO1YGR154C 1071 nt4.71□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 BGL2YGR282C 942 nt4.71□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 YIR043CYIR043C 693 nt4.71□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt4.71□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 PML1YLR016C 615 nt4.71□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 SCW10YMR305C 1170 nt4.71□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 FPK1YNR047W 2682 nt4.71□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 SER33YIL074C 1410 nt4.71□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 MKS1YNL076W 1755 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 MGS1YNL218W 1764 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 PEX29YDR479C 1665 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 ARC1YGL105W 1131 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 SPL2YHR136C 447 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 SPO12YHR152W 522 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 YKL169CYKL169C 384 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 NDJ1YOL104C 1059 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 FEX1YOR390W 1128 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 RMI1YPL024W 726 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 FEX2YPL279C 1128 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 SDA1YGR245C 2304 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 TDA11YHR159W 1515 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 MCH4YOL119C 1506 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 JEM1YJL073W 1938 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 STR2YJR130C 1920 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 ISR1YPR106W 1332 nt4.7□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 TPS3YMR261C 3165 nt4.69□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 RKM4YDR257C 1485 nt4.69□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 CAB3YKL088W 1716 nt4.69□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 YHR177WYHR177W 1362 nt4.69□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 GRC3YLL035W 1899 nt4.69□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 TRM8YDL201W 861 nt4.69□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 MAD2YJL030W 591 nt4.69□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 MDM12YOL009C 816 nt4.69□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 TRM10YOL093W 882 nt4.69□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 SED4YCR067C 3198 nt4.69□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 ARH1YDR376W 1482 nt4.69□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 FAP1YNL023C 2898 nt4.68□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 YPL245WYPL245W 1365 nt4.68□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 CDC15YAR019C 2925 nt4.68□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 HUL4YJR036C 2679 nt4.68□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 AAD4YDL243C 990 nt4.68□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 PCL6YER059W 1263 nt4.68□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 LYS5YGL154C 819 nt4.68□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 SPC42YKL042W 1092 nt4.68□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 SFT2YBL102W 648 nt4.68□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 snR10snR10 245 nt4.68□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 CBP3YPL215W 1008 nt4.68□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 TIP41YPR040W 1071 nt4.68□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 TRE1YPL176C 2352 nt4.68□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 CDC48YDL126C 2508 nt4.68□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 THP1YOL072W 1368 nt4.67□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 DCV1YFR012W 609 nt4.67□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 SEH1YGL100W 1050 nt4.67□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 NIT2YJL126W 924 nt4.67□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 OSW5YMR148W 447 nt4.67□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 RPC19YNL113W 429 nt4.67□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 RPL21BYPL079W 483 nt4.67□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 IML2YJL082W 2196 nt4.66□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 YNG2YHR090C 849 nt4.66□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 RRT7YLL030C 342 nt4.66□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 STE7YDL159W 1548 nt4.66□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 PRO2YOR323C 1371 nt4.65□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 SMP1YBR182C 1359 nt4.65□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 SVF1YDR346C 1446 nt4.65□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 YDR132CYDR132C 1488 nt4.65□□□□□ -1.66
RRN11Q04712 IMG2YCR071C 441 nt4.65□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 NVJ1YHR195W 966 nt4.65□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt4.65□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 YJL220WYJL220W 453 nt4.65□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 DBR1YKL149C 1218 nt4.65□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 NTR2YKR022C 969 nt4.65□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 PEX12YMR026C 1200 nt4.65□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 YMR085WYMR085W 1299 nt4.65□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 CUZ1YNL155W 825 nt4.65□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 YBR139WYBR139W 1527 nt4.65□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 GMC1YDR506C 1827 nt4.65□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 MPC54YOR177C 1395 nt4.65□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 MHF2YDL160C-A 243 nt4.64□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 YLR125WYLR125W 411 nt4.64□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 YMR114CYMR114C 1107 nt4.64□□□□□ -1.67
RRN11Q04712 SPC24YMR117C 642 nt4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 59 ms