Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TFF2Q03403 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TFF2Q03403 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms