Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TOP2BQ02880 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
TOP2BQ02880 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC38.32■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
TOP2BQ02880 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TOP2BQ02880 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.6 ms