Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NHLH1Q02575 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NHLH1Q02575 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NHLH1Q02575 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms