Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CENPEQ02224 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CENPEQ02224 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms