Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA6Q01524 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA6Q01524 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms