Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	snR7-L	snR7-L	214 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	THI13	YDL244W	1023 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	JAC1	YGL018C	555 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	THI11	YJR156C	1023 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	CIN5	YOR028C	888 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	VMS1	YDR049W	1899 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	SLD2	YKL108W	1362 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	TIF4632	YGL049C	2745 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	YIL001W	YIL001W	1542 nt		2.83	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	NSE5	YML023C	1671 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	YOL153C	YOL153C	1746 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	BUD8	YLR353W	1812 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	SOL4	YGR248W	768 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	Q0182	Q0182	405 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	CIA2	YHR122W	696 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	FMP33	YJL161W	543 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	RAD27	YKL113C	1149 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	DBR1	YKL149C	1218 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	YML131W	YML131W	1098 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	YMR315W	YMR315W	1050 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	ELA1	YNL230C	1140 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	EMP47	YFL048C	1338 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	YND1	YER005W	1893 nt		2.82	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	TRF5	YNL299W	1929 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	ATM1	YMR301C	2073 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	HSP31	YDR533C	714 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	SPR6	YER115C	576 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	RPL8A	YHL033C	771 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	SHE1	YBL031W	1017 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	OST3	YOR085W	1053 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	GPI18	YBR004C	1302 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	FAR10	YLR238W	1437 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	CIT3	YPR001W	1461 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	CCZ1	YBR131W	2115 nt		2.81	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	SRV2	YNL138W	1581 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	tQ(UUG)C	tQ(UUG)C	72 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	tQ(UUG)D1	tQ(UUG)D1	72 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	tQ(UUG)D2	tQ(UUG)D2	72 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	tQ(UUG)D3	tQ(UUG)D3	72 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	tQ(UUG)E1	tQ(UUG)E1	72 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	tQ(UUG)H	tQ(UUG)H	72 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	tQ(UUG)L	tQ(UUG)L	72 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	SEC13	YLR208W	894 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	YLR407W	YLR407W	687 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	TRS85	YDR108W	2097 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	RAD1	YPL022W	3303 nt		2.8	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	GIP2	YER054C	1647 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	CHD1	YER164W	4407 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	MLF3	YNL074C	1359 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	LDB18	YLL049W	540 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	RCL1	YOL010W	1104 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	RDL2	YOR286W	450 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	THI7	YLR237W	1797 nt		2.79	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	RRN11	YML043C	1524 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	STP4	YDL048C	1473 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	KCC4	YCL024W	3114 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	PRE9	YGR135W	777 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	SUI1	YNL244C	327 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	VPS68	YOL129W	555 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	ICY2	YPL250C	411 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	SRB6	YBR253W	366 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	EFM2	YBR271W	1260 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	NUG1	YER006W	1563 nt		2.78	□□□□□ -1.96
DDR2	P89113	MET12	YPL023C	1974 nt		2.78	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	ALD3	YMR169C	1521 nt		2.78	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	ALD2	YMR170C	1521 nt		2.78	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	MMT1	YMR177W	1533 nt		2.78	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	OCA4	YCR095C	1089 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	HSP42	YDR171W	1128 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	RPL14A	YKL006W	417 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	CNB1	YKL190W	528 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	SIW14	YNL032W	846 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	PCL1	YNL289W	840 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	YPR071W	YPR071W	636 nt		2.77	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	PTA1	YAL043C	2358 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	GCR1	YPL075W	2358 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	VHS3	YOR054C	2025 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	STU1	YBL034C	4542 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	FLO8	YER109C	2400 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	COQ4	YDR204W	1008 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	SOH1	YGL127C	384 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	YHR112C	YHR112C	1137 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	CSR1	YLR380W	1227 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	YML031C-A	YML031C-A	336 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	MDM12	YOL009C	816 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	ECM23	YPL021W	564 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	UBA3	YPR066W	900 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	PUS7	YOR243C	2031 nt		2.76	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	SNF3	YDL194W	2655 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	GCR2	YNL199C	1605 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	NOC2	YOR206W	2133 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	DBP3	YGL078C	1572 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	KRS1	YDR037W	1776 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	YLF2	YHL014C	1218 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	NKP2	YLR315W	462 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	IMP2	YMR035W	534 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	YMR085W	YMR085W	1299 nt		2.75	□□□□□ -1.97
DDR2	P89113	PWR1	PWR1	941 nt		2.75	□□□□□ -1.97

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