Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPCAP84074 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPCAP84074 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPCAP84074 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPCAP84074 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPCAP84074 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPCAP84074 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPCAP84074 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HPCAP84074 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPCAP84074 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPCAP84074 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPCAP84074 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPCAP84074 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPCAP84074 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPCAP84074 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HPCAP84074 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPCAP84074 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPCAP84074 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPCAP84074 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPCAP84074 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPCAP84074 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HPCAP84074 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPCAP84074 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPCAP84074 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPCAP84074 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPCAP84074 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPCAP84074 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPCAP84074 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPCAP84074 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPCAP84074 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HPCAP84074 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPCAP84074 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPCAP84074 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPCAP84074 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPCAP84074 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPCAP84074 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPCAP84074 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPCAP84074 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HPCAP84074 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPCAP84074 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPCAP84074 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPCAP84074 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPCAP84074 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HPCAP84074 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HPCAP84074 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPCAP84074 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPCAP84074 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPCAP84074 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HPCAP84074 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPCAP84074 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPCAP84074 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPCAP84074 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPCAP84074 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPCAP84074 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HPCAP84074 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPCAP84074 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPCAP84074 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPCAP84074 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPCAP84074 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPCAP84074 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPCAP84074 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPCAP84074 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HPCAP84074 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPCAP84074 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HPCAP84074 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPCAP84074 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPCAP84074 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPCAP84074 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPCAP84074 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPCAP84074 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPCAP84074 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPCAP84074 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPCAP84074 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPCAP84074 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPCAP84074 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HPCAP84074 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPCAP84074 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPCAP84074 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPCAP84074 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPCAP84074 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HPCAP84074 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPCAP84074 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPCAP84074 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPCAP84074 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HPCAP84074 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPCAP84074 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPCAP84074 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPCAP84074 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPCAP84074 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPCAP84074 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPCAP84074 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPCAP84074 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPCAP84074 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPCAP84074 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPCAP84074 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HPCAP84074 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPCAP84074 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPCAP84074 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPCAP84074 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HPCAP84074 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms