Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ASIC1P78348 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ASIC1P78348 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms