Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBA1P69905 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBA1P69905 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBA1P69905 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBA1P69905 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBA1P69905 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBA1P69905 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBA1P69905 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBA1P69905 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBA1P69905 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBA1P69905 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HBA1P69905 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HBA1P69905 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HBA1P69905 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HBA1P69905 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HBA1P69905 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HBA1P69905 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HBA1P69905 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HBA1P69905 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBA1P69905 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBA1P69905 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBA1P69905 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBA1P69905 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBA1P69905 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBA1P69905 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBA1P69905 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBA1P69905 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBA1P69905 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBA1P69905 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBA1P69905 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBA1P69905 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBA1P69905 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBA1P69905 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBA1P69905 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBA1P69905 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBA1P69905 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBA1P69905 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBA1P69905 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBA1P69905 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBA1P69905 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBA1P69905 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBA1P69905 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBA1P69905 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBA1P69905 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBA1P69905 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBA1P69905 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HBA1P69905 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBA1P69905 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBA1P69905 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBA1P69905 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBA1P69905 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBA1P69905 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBA1P69905 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBA1P69905 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBA1P69905 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBA1P69905 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBA1P69905 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBA1P69905 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HBA1P69905 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBA1P69905 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBA1P69905 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBA1P69905 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBA1P69905 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HBA1P69905 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HBA1P69905 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HBA1P69905 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HBA1P69905 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HBA1P69905 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HBA1P69905 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HBA1P69905 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HBA1P69905 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HBA1P69905 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HBA1P69905 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HBA1P69905 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HBA1P69905 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HBA1P69905 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HBA1P69905 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HBA1P69905 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HBA1P69905 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HBA1P69905 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HBA1P69905 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HBA1P69905 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HBA1P69905 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HBA1P69905 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HBA1P69905 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms