Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HERVK_113P63132 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERVK_113P63132 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms