Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HERVK_113P63121 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HERVK_113P63121 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms