Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP2P63027 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP2P63027 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms