Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNRPEP62304 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNRPEP62304 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms