Protein–RNA interactions for Protein: P62140

PPP1CB, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CBP62140 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PPP1CBP62140 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPP1CBP62140 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PPP1CBP62140 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms