Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VBP1P61758 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VBP1P61758 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VBP1P61758 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VBP1P61758 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VBP1P61758 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VBP1P61758 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VBP1P61758 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VBP1P61758 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VBP1P61758 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VBP1P61758 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VBP1P61758 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VBP1P61758 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VBP1P61758 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VBP1P61758 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VBP1P61758 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VBP1P61758 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VBP1P61758 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VBP1P61758 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VBP1P61758 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VBP1P61758 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VBP1P61758 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VBP1P61758 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VBP1P61758 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VBP1P61758 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VBP1P61758 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VBP1P61758 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VBP1P61758 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VBP1P61758 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VBP1P61758 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VBP1P61758 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VBP1P61758 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VBP1P61758 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VBP1P61758 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VBP1P61758 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VBP1P61758 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VBP1P61758 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VBP1P61758 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VBP1P61758 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VBP1P61758 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VBP1P61758 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VBP1P61758 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VBP1P61758 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VBP1P61758 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VBP1P61758 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VBP1P61758 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VBP1P61758 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VBP1P61758 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VBP1P61758 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VBP1P61758 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VBP1P61758 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VBP1P61758 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VBP1P61758 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VBP1P61758 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VBP1P61758 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VBP1P61758 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VBP1P61758 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VBP1P61758 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VBP1P61758 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VBP1P61758 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VBP1P61758 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VBP1P61758 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VBP1P61758 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VBP1P61758 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VBP1P61758 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VBP1P61758 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VBP1P61758 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VBP1P61758 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VBP1P61758 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VBP1P61758 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VBP1P61758 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VBP1P61758 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VBP1P61758 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VBP1P61758 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VBP1P61758 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VBP1P61758 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VBP1P61758 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VBP1P61758 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VBP1P61758 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VBP1P61758 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VBP1P61758 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VBP1P61758 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VBP1P61758 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VBP1P61758 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VBP1P61758 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VBP1P61758 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms