Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCALDP61601 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCALDP61601 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCALDP61601 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCALDP61601 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCALDP61601 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCALDP61601 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCALDP61601 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCALDP61601 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCALDP61601 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCALDP61601 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCALDP61601 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCALDP61601 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCALDP61601 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCALDP61601 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCALDP61601 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCALDP61601 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCALDP61601 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCALDP61601 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCALDP61601 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCALDP61601 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCALDP61601 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCALDP61601 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCALDP61601 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCALDP61601 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCALDP61601 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCALDP61601 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCALDP61601 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCALDP61601 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCALDP61601 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCALDP61601 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCALDP61601 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCALDP61601 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCALDP61601 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCALDP61601 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCALDP61601 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCALDP61601 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCALDP61601 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCALDP61601 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCALDP61601 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCALDP61601 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCALDP61601 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCALDP61601 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCALDP61601 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCALDP61601 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCALDP61601 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NCALDP61601 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCALDP61601 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCALDP61601 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCALDP61601 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCALDP61601 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCALDP61601 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCALDP61601 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCALDP61601 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCALDP61601 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCALDP61601 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCALDP61601 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCALDP61601 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCALDP61601 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCALDP61601 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCALDP61601 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCALDP61601 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCALDP61601 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCALDP61601 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCALDP61601 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCALDP61601 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCALDP61601 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCALDP61601 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCALDP61601 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCALDP61601 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCALDP61601 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCALDP61601 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCALDP61601 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCALDP61601 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCALDP61601 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCALDP61601 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCALDP61601 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCALDP61601 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCALDP61601 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCALDP61601 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCALDP61601 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCALDP61601 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCALDP61601 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCALDP61601 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCALDP61601 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCALDP61601 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCALDP61601 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCALDP61601 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCALDP61601 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCALDP61601 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCALDP61601 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCALDP61601 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCALDP61601 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCALDP61601 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NCALDP61601 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCALDP61601 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCALDP61601 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCALDP61601 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCALDP61601 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NCALDP61601 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms