Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P61574 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P61574 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms