Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2FP61218 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2FP61218 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms