Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF3P61204 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF3P61204 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF3P61204 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF3P61204 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF3P61204 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARF3P61204 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARF3P61204 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARF3P61204 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ARF3P61204 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF3P61204 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF3P61204 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF3P61204 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF3P61204 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF3P61204 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF3P61204 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF3P61204 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF3P61204 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF3P61204 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF3P61204 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF3P61204 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ARF3P61204 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF3P61204 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF3P61204 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF3P61204 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF3P61204 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF3P61204 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF3P61204 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF3P61204 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF3P61204 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF3P61204 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ARF3P61204 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARF3P61204 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ARF3P61204 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF3P61204 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF3P61204 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF3P61204 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF3P61204 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARF3P61204 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF3P61204 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF3P61204 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF3P61204 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF3P61204 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF3P61204 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF3P61204 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF3P61204 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF3P61204 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF3P61204 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF3P61204 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARF3P61204 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF3P61204 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF3P61204 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF3P61204 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF3P61204 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF3P61204 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF3P61204 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF3P61204 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF3P61204 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ARF3P61204 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF3P61204 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF3P61204 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF3P61204 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF3P61204 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF3P61204 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF3P61204 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF3P61204 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF3P61204 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF3P61204 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF3P61204 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARF3P61204 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF3P61204 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF3P61204 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF3P61204 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF3P61204 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF3P61204 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF3P61204 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF3P61204 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF3P61204 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF3P61204 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF3P61204 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF3P61204 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF3P61204 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF3P61204 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF3P61204 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF3P61204 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF3P61204 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF3P61204 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF3P61204 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF3P61204 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF3P61204 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF3P61204 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARF3P61204 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARF3P61204 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARF3P61204 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARF3P61204 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARF3P61204 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARF3P61204 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF3P61204 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF3P61204 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF3P61204 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms