Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHMP4BP1P59074 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHMP4BP1P59074 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms