Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
YBEYP58557 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBEYP58557 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBEYP58557 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBEYP58557 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBEYP58557 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBEYP58557 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBEYP58557 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBEYP58557 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBEYP58557 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBEYP58557 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
YBEYP58557 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBEYP58557 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBEYP58557 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBEYP58557 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBEYP58557 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBEYP58557 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBEYP58557 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
YBEYP58557 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBEYP58557 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBEYP58557 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBEYP58557 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBEYP58557 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBEYP58557 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBEYP58557 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBEYP58557 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBEYP58557 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBEYP58557 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBEYP58557 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBEYP58557 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBEYP58557 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBEYP58557 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBEYP58557 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBEYP58557 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBEYP58557 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBEYP58557 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBEYP58557 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBEYP58557 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBEYP58557 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBEYP58557 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBEYP58557 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
YBEYP58557 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBEYP58557 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBEYP58557 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBEYP58557 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBEYP58557 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBEYP58557 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBEYP58557 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBEYP58557 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBEYP58557 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBEYP58557 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBEYP58557 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBEYP58557 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBEYP58557 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBEYP58557 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBEYP58557 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBEYP58557 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBEYP58557 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBEYP58557 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
YBEYP58557 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBEYP58557 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBEYP58557 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBEYP58557 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBEYP58557 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBEYP58557 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBEYP58557 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBEYP58557 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBEYP58557 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBEYP58557 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBEYP58557 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBEYP58557 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBEYP58557 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBEYP58557 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBEYP58557 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBEYP58557 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
YBEYP58557 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBEYP58557 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBEYP58557 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBEYP58557 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBEYP58557 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBEYP58557 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBEYP58557 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBEYP58557 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBEYP58557 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBEYP58557 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms