Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EEFSECP57772 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EEFSECP57772 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms