Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBASH3AP57075 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms