Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSCP56915 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSCP56915 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSCP56915 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSCP56915 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSCP56915 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSCP56915 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSCP56915 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSCP56915 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSCP56915 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSCP56915 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSCP56915 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSCP56915 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSCP56915 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSCP56915 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSCP56915 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSCP56915 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSCP56915 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSCP56915 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSCP56915 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSCP56915 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSCP56915 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GSCP56915 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSCP56915 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSCP56915 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSCP56915 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSCP56915 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GSCP56915 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSCP56915 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSCP56915 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSCP56915 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSCP56915 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSCP56915 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSCP56915 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSCP56915 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSCP56915 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSCP56915 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSCP56915 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSCP56915 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSCP56915 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSCP56915 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSCP56915 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSCP56915 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSCP56915 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSCP56915 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSCP56915 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSCP56915 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSCP56915 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSCP56915 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSCP56915 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSCP56915 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSCP56915 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSCP56915 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSCP56915 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSCP56915 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSCP56915 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSCP56915 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSCP56915 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSCP56915 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSCP56915 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSCP56915 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GSCP56915 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSCP56915 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSCP56915 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSCP56915 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSCP56915 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSCP56915 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSCP56915 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSCP56915 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSCP56915 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSCP56915 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms