Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTBP2P56545 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CTBP2P56545 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms