Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPTEP56180 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPTEP56180 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TPTEP56180 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPTEP56180 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPTEP56180 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPTEP56180 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPTEP56180 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TPTEP56180 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TPTEP56180 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPTEP56180 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPTEP56180 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPTEP56180 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPTEP56180 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPTEP56180 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPTEP56180 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPTEP56180 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPTEP56180 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TPTEP56180 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPTEP56180 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPTEP56180 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPTEP56180 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPTEP56180 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPTEP56180 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPTEP56180 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPTEP56180 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPTEP56180 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TPTEP56180 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPTEP56180 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPTEP56180 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPTEP56180 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPTEP56180 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPTEP56180 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPTEP56180 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPTEP56180 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPTEP56180 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TPTEP56180 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TPTEP56180 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPTEP56180 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPTEP56180 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TPTEP56180 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPTEP56180 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPTEP56180 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPTEP56180 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPTEP56180 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TPTEP56180 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPTEP56180 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPTEP56180 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPTEP56180 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPTEP56180 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPTEP56180 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPTEP56180 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TPTEP56180 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPTEP56180 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPTEP56180 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TPTEP56180 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPTEP56180 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPTEP56180 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPTEP56180 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPTEP56180 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPTEP56180 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPTEP56180 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPTEP56180 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPTEP56180 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPTEP56180 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPTEP56180 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPTEP56180 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPTEP56180 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPTEP56180 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPTEP56180 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPTEP56180 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPTEP56180 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPTEP56180 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPTEP56180 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPTEP56180 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPTEP56180 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPTEP56180 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPTEP56180 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPTEP56180 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPTEP56180 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPTEP56180 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPTEP56180 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPTEP56180 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPTEP56180 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPTEP56180 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPTEP56180 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms