Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SH3BGRP55822 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms