Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC13P55735 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC13P55735 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC13P55735 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC13P55735 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC13P55735 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC13P55735 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC13P55735 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC13P55735 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC13P55735 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC13P55735 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC13P55735 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC13P55735 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC13P55735 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC13P55735 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC13P55735 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC13P55735 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC13P55735 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC13P55735 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC13P55735 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC13P55735 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC13P55735 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC13P55735 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC13P55735 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC13P55735 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC13P55735 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC13P55735 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC13P55735 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC13P55735 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC13P55735 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC13P55735 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC13P55735 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC13P55735 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC13P55735 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC13P55735 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC13P55735 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC13P55735 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC13P55735 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC13P55735 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC13P55735 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC13P55735 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC13P55735 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC13P55735 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC13P55735 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC13P55735 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC13P55735 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC13P55735 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC13P55735 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC13P55735 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC13P55735 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC13P55735 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC13P55735 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC13P55735 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC13P55735 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC13P55735 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC13P55735 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC13P55735 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC13P55735 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC13P55735 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC13P55735 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC13P55735 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC13P55735 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC13P55735 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC13P55735 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC13P55735 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC13P55735 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC13P55735 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC13P55735 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC13P55735 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEC13P55735 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC13P55735 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC13P55735 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC13P55735 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC13P55735 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC13P55735 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC13P55735 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC13P55735 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC13P55735 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC13P55735 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC13P55735 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
SEC13P55735 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC13P55735 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC13P55735 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC13P55735 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC13P55735 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC13P55735 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC13P55735 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC13P55735 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC13P55735 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC13P55735 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC13P55735 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC13P55735 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC13P55735 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEC13P55735 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC13P55735 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC13P55735 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC13P55735 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC13P55735 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC13P55735 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC13P55735 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms