Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RARSP54136 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RARSP54136 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RARSP54136 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RARSP54136 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RARSP54136 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RARSP54136 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RARSP54136 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RARSP54136 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RARSP54136 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RARSP54136 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RARSP54136 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RARSP54136 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RARSP54136 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RARSP54136 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RARSP54136 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RARSP54136 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RARSP54136 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
RARSP54136 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RARSP54136 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RARSP54136 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RARSP54136 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RARSP54136 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RARSP54136 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RARSP54136 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RARSP54136 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RARSP54136 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RARSP54136 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RARSP54136 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RARSP54136 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RARSP54136 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RARSP54136 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RARSP54136 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RARSP54136 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RARSP54136 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RARSP54136 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RARSP54136 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RARSP54136 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RARSP54136 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RARSP54136 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RARSP54136 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RARSP54136 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RARSP54136 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RARSP54136 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RARSP54136 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RARSP54136 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RARSP54136 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RARSP54136 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARSP54136 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARSP54136 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARSP54136 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARSP54136 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARSP54136 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARSP54136 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARSP54136 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARSP54136 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RARSP54136 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RARSP54136 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RARSP54136 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RARSP54136 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RARSP54136 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RARSP54136 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RARSP54136 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RARSP54136 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RARSP54136 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARSP54136 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARSP54136 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARSP54136 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARSP54136 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARSP54136 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RARSP54136 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RARSP54136 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RARSP54136 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RARSP54136 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RARSP54136 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RARSP54136 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RARSP54136 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARSP54136 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARSP54136 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RARSP54136 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RARSP54136 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RARSP54136 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RARSP54136 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RARSP54136 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RARSP54136 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RARSP54136 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms