Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDR1P51861 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDR1P51861 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDR1P51861 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDR1P51861 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDR1P51861 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDR1P51861 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDR1P51861 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDR1P51861 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDR1P51861 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDR1P51861 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDR1P51861 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDR1P51861 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR1P51861 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR1P51861 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR1P51861 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR1P51861 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR1P51861 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR1P51861 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR1P51861 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR1P51861 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR1P51861 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDR1P51861 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDR1P51861 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR1P51861 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR1P51861 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR1P51861 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR1P51861 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR1P51861 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR1P51861 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR1P51861 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR1P51861 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR1P51861 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR1P51861 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR1P51861 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR1P51861 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR1P51861 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDR1P51861 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR1P51861 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR1P51861 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR1P51861 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR1P51861 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR1P51861 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR1P51861 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR1P51861 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR1P51861 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR1P51861 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR1P51861 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR1P51861 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR1P51861 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDR1P51861 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR1P51861 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR1P51861 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR1P51861 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR1P51861 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR1P51861 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR1P51861 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR1P51861 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR1P51861 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDR1P51861 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR1P51861 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR1P51861 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR1P51861 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR1P51861 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR1P51861 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR1P51861 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR1P51861 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR1P51861 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDR1P51861 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDR1P51861 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms