Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF1P51825 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF1P51825 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF1P51825 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF1P51825 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF1P51825 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF1P51825 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF1P51825 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AFF1P51825 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF1P51825 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF1P51825 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF1P51825 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF1P51825 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF1P51825 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF1P51825 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF1P51825 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF1P51825 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF1P51825 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF1P51825 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AFF1P51825 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF1P51825 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF1P51825 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF1P51825 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF1P51825 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF1P51825 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF1P51825 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF1P51825 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF1P51825 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF1P51825 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF1P51825 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AFF1P51825 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF1P51825 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF1P51825 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF1P51825 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF1P51825 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF1P51825 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AFF1P51825 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFF1P51825 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFF1P51825 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFF1P51825 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFF1P51825 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFF1P51825 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFF1P51825 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AFF1P51825 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF1P51825 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF1P51825 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF1P51825 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF1P51825 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF1P51825 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF1P51825 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF1P51825 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF1P51825 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF1P51825 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AFF1P51825 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF1P51825 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF1P51825 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF1P51825 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF1P51825 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF1P51825 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF1P51825 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF1P51825 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF1P51825 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF1P51825 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AFF1P51825 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF1P51825 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF1P51825 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF1P51825 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF1P51825 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF1P51825 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF1P51825 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF1P51825 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AFF1P51825 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF1P51825 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF1P51825 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF1P51825 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF1P51825 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF1P51825 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF1P51825 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF1P51825 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AFF1P51825 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF1P51825 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF1P51825 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF1P51825 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF1P51825 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF1P51825 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF1P51825 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF1P51825 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF1P51825 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF1P51825 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF1P51825 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF1P51825 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF1P51825 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AFF1P51825 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF1P51825 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF1P51825 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF1P51825 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF1P51825 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF1P51825 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF1P51825 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AFF1P51825 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms