Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC3P51654 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC3P51654 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC3P51654 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC3P51654 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC3P51654 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC3P51654 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC3P51654 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC3P51654 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC3P51654 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC3P51654 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC3P51654 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC3P51654 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC3P51654 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC3P51654 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC3P51654 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC3P51654 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC3P51654 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC3P51654 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC3P51654 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC3P51654 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC3P51654 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC3P51654 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC3P51654 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPC3P51654 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC3P51654 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC3P51654 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC3P51654 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC3P51654 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC3P51654 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC3P51654 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC3P51654 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC3P51654 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC3P51654 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC3P51654 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC3P51654 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC3P51654 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC3P51654 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC3P51654 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC3P51654 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC3P51654 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC3P51654 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC3P51654 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC3P51654 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC3P51654 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC3P51654 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC3P51654 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC3P51654 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC3P51654 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC3P51654 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC3P51654 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC3P51654 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC3P51654 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC3P51654 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC3P51654 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC3P51654 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC3P51654 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC3P51654 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC3P51654 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC3P51654 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC3P51654 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC3P51654 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC3P51654 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC3P51654 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC3P51654 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC3P51654 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC3P51654 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC3P51654 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC3P51654 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC3P51654 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC3P51654 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC3P51654 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC3P51654 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC3P51654 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC3P51654 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC3P51654 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC3P51654 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC3P51654 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC3P51654 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC3P51654 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC3P51654 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC3P51654 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC3P51654 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms