Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE6CP51160 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE6CP51160 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms