Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NUP153P49790 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NUP153P49790 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NUP153P49790 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NUP153P49790 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NUP153P49790 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NUP153P49790 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NUP153P49790 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NUP153P49790 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NUP153P49790 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NUP153P49790 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NUP153P49790 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NUP153P49790 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NUP153P49790 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NUP153P49790 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NUP153P49790 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NUP153P49790 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NUP153P49790 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NUP153P49790 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NUP153P49790 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
NUP153P49790 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NUP153P49790 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
NUP153P49790 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NUP153P49790 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NUP153P49790 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NUP153P49790 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NUP153P49790 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NUP153P49790 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP153P49790 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP153P49790 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP153P49790 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP153P49790 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP153P49790 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP153P49790 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP153P49790 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP153P49790 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP153P49790 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP153P49790 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP153P49790 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NUP153P49790 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NUP153P49790 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NUP153P49790 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
NUP153P49790 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NUP153P49790 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NUP153P49790 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NUP153P49790 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NUP153P49790 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NUP153P49790 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NUP153P49790 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NUP153P49790 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NUP153P49790 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NUP153P49790 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NUP153P49790 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NUP153P49790 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
NUP153P49790 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NUP153P49790 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NUP153P49790 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NUP153P49790 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NUP153P49790 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NUP153P49790 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NUP153P49790 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NUP153P49790 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NUP153P49790 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.3
NUP153P49790 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.3
NUP153P49790 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NUP153P49790 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
NUP153P49790 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NUP153P49790 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NUP153P49790 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NUP153P49790 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NUP153P49790 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NUP153P49790 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NUP153P49790 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NUP153P49790 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NUP153P49790 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
NUP153P49790 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NUP153P49790 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NUP153P49790 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NUP153P49790 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NUP153P49790 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NUP153P49790 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NUP153P49790 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NUP153P49790 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NUP153P49790 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
NUP153P49790 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
NUP153P49790 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP153P49790 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP153P49790 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP153P49790 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP153P49790 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP153P49790 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP153P49790 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP153P49790 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP153P49790 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP153P49790 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NUP153P49790 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NUP153P49790 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NUP153P49790 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NUP153P49790 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NUP153P49790 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms