Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB3P49720 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB3P49720 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms