Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FNTAP49354 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTAP49354 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTAP49354 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTAP49354 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTAP49354 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTAP49354 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTAP49354 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTAP49354 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTAP49354 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTAP49354 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTAP49354 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FNTAP49354 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTAP49354 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTAP49354 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTAP49354 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTAP49354 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTAP49354 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTAP49354 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTAP49354 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTAP49354 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FNTAP49354 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTAP49354 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTAP49354 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTAP49354 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTAP49354 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTAP49354 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTAP49354 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTAP49354 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTAP49354 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTAP49354 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTAP49354 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FNTAP49354 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNTAP49354 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FNTAP49354 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FNTAP49354 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
FNTAP49354 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTAP49354 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTAP49354 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTAP49354 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTAP49354 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTAP49354 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTAP49354 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTAP49354 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTAP49354 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTAP49354 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTAP49354 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FNTAP49354 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FNTAP49354 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTAP49354 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTAP49354 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTAP49354 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTAP49354 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTAP49354 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTAP49354 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTAP49354 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTAP49354 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTAP49354 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTAP49354 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTAP49354 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FNTAP49354 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTAP49354 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTAP49354 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTAP49354 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTAP49354 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTAP49354 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTAP49354 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTAP49354 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FNTAP49354 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNTAP49354 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNTAP49354 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms