Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMTP48728 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMTP48728 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMTP48728 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMTP48728 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMTP48728 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMTP48728 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMTP48728 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMTP48728 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMTP48728 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMTP48728 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMTP48728 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMTP48728 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMTP48728 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMTP48728 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMTP48728 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMTP48728 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMTP48728 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMTP48728 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMTP48728 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMTP48728 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMTP48728 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMTP48728 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMTP48728 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AMTP48728 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMTP48728 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMTP48728 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMTP48728 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMTP48728 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMTP48728 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMTP48728 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMTP48728 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMTP48728 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMTP48728 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
AMTP48728 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMTP48728 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMTP48728 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMTP48728 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMTP48728 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMTP48728 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMTP48728 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMTP48728 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMTP48728 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMTP48728 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMTP48728 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMTP48728 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
AMTP48728 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMTP48728 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMTP48728 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMTP48728 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
AMTP48728 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms