Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZBP47756 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPZBP47756 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPZBP47756 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPZBP47756 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPZBP47756 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPZBP47756 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPZBP47756 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPZBP47756 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPZBP47756 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPZBP47756 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPZBP47756 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPZBP47756 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPZBP47756 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms