Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABIFP47224 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABIFP47224 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABIFP47224 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABIFP47224 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABIFP47224 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABIFP47224 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABIFP47224 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABIFP47224 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABIFP47224 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABIFP47224 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABIFP47224 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABIFP47224 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABIFP47224 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABIFP47224 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABIFP47224 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABIFP47224 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABIFP47224 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABIFP47224 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABIFP47224 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABIFP47224 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABIFP47224 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABIFP47224 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABIFP47224 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABIFP47224 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABIFP47224 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABIFP47224 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABIFP47224 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABIFP47224 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABIFP47224 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABIFP47224 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABIFP47224 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABIFP47224 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RABIFP47224 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABIFP47224 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RABIFP47224 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABIFP47224 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABIFP47224 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABIFP47224 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABIFP47224 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABIFP47224 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABIFP47224 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RABIFP47224 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABIFP47224 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABIFP47224 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RABIFP47224 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABIFP47224 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABIFP47224 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABIFP47224 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABIFP47224 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RABIFP47224 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABIFP47224 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABIFP47224 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABIFP47224 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABIFP47224 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABIFP47224 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RABIFP47224 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABIFP47224 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABIFP47224 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABIFP47224 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RABIFP47224 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RABIFP47224 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABIFP47224 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABIFP47224 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABIFP47224 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABIFP47224 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABIFP47224 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABIFP47224 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABIFP47224 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABIFP47224 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABIFP47224 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABIFP47224 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABIFP47224 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABIFP47224 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABIFP47224 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABIFP47224 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RABIFP47224 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABIFP47224 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABIFP47224 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABIFP47224 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABIFP47224 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABIFP47224 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABIFP47224 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABIFP47224 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RABIFP47224 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms