Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSFMP43897 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSFMP43897 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSFMP43897 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSFMP43897 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSFMP43897 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSFMP43897 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSFMP43897 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSFMP43897 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSFMP43897 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSFMP43897 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSFMP43897 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TSFMP43897 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSFMP43897 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSFMP43897 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSFMP43897 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSFMP43897 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSFMP43897 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSFMP43897 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TSFMP43897 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSFMP43897 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSFMP43897 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSFMP43897 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSFMP43897 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSFMP43897 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSFMP43897 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSFMP43897 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSFMP43897 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSFMP43897 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TSFMP43897 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSFMP43897 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSFMP43897 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSFMP43897 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSFMP43897 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSFMP43897 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TSFMP43897 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSFMP43897 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSFMP43897 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSFMP43897 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSFMP43897 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSFMP43897 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSFMP43897 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSFMP43897 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSFMP43897 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSFMP43897 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSFMP43897 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSFMP43897 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSFMP43897 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSFMP43897 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSFMP43897 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSFMP43897 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSFMP43897 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TSFMP43897 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSFMP43897 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSFMP43897 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSFMP43897 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSFMP43897 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms