Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATA4P43694 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATA4P43694 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATA4P43694 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATA4P43694 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATA4P43694 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATA4P43694 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATA4P43694 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GATA4P43694 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATA4P43694 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATA4P43694 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATA4P43694 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATA4P43694 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATA4P43694 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATA4P43694 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GATA4P43694 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GATA4P43694 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATA4P43694 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATA4P43694 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATA4P43694 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATA4P43694 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATA4P43694 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATA4P43694 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATA4P43694 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATA4P43694 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATA4P43694 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GATA4P43694 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATA4P43694 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATA4P43694 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATA4P43694 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATA4P43694 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATA4P43694 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATA4P43694 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GATA4P43694 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GATA4P43694 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATA4P43694 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATA4P43694 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATA4P43694 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATA4P43694 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATA4P43694 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATA4P43694 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATA4P43694 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATA4P43694 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATA4P43694 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATA4P43694 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATA4P43694 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATA4P43694 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATA4P43694 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATA4P43694 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA4P43694 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA4P43694 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA4P43694 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA4P43694 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA4P43694 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA4P43694 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA4P43694 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA4P43694 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA4P43694 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA4P43694 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA4P43694 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GATA4P43694 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATA4P43694 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATA4P43694 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATA4P43694 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATA4P43694 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATA4P43694 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATA4P43694 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms